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2023-09-28

亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室夏瑞团队发表TBtools-Ⅱ，为个性化生物数据分析提供解决方案

　　9月22日，亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、园艺学院夏瑞团队在Molecular Plant（IF=27.5)在线发表了题为TBtools-II: A One for All, All for One Bioinformatics Platform for Biological Big-data Mining的研究论文，系统介绍和描述TBtools 的新版本，即TBtools-II。TBtools-II 在TBtools-I 的基础上优化并新增了100+个功能，开发了插件（Plugin）模式并架设了插件仓库（Plugin Store）。基于此，解决了软件功能全面性与灵活性的主要冲突。（论文链接：https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(23)00281-2）　　为辅助更多植物科学家处理生物大数据，TBtools-I 应运而生，并于2020年08月发表于Molecular Plant 期刊（Chen et al., 2020），截止目前引用＞5000次。过去三年，随着植物生物信息领域的发展和个性化需求
2023-09-26

周海/庄楚雄课题组发现温敏雄性不育水稻不育起点温度调控的机制

近日，本校生命科学学院周海/庄楚雄团队在Molecular Plant上发表了题为“The E3 ubiquitin ligase CSIT1 regulates critical sterility-inducing temperature by ribosome-associated quality control to safeguard two-line hybrid breeding in rice”的论文（论文链接：https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(23)00287-3），首次揭示了E3泛素连接酶CSIT1通过蛋白质质量控制过程调控水稻温敏雄性不育的不育起点温度的分子机制，为解决两系杂交育种中温敏雄性不育系不育起点温度的选育问题提供了新思路。两系杂交水稻育种是我国科学家首创的育种技术，相比三系杂交水稻育种技术，它具有不受恢保关系限制、配组自由、更加有利于利用杂种优势、育种程序更加简单和成本降低等优势，因而得到了迅速的发展。两系杂交水稻由环境敏感型雄性不育系和恢复系组成。由于水稻温敏雄性不育基因t
2023-09-22

资源环境学院根系生物学研究中心揭示GmPAP15a调控大豆利用植酸磷的分子机制

近日，资源环境学院根系生物学研究中心、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，田江研究员课题组在Plant, Cell Environment（中科院一区Top期刊，IF = 7.3）发表了题为“Impaired glycosylation of GmPAP15a, a root-associated purple acid phosphatase, inhibits extracellular phytate-P utilization in soybean”的研究论文。土壤累积了大量难以被植物直接吸收利用的有机磷源。据统计，土壤磷库中有机磷含量约占土壤总磷含量的30~65%，而植酸磷约占土壤有机磷总量的60~80%。所以，提高作物对土壤有机磷源利用的能力对于土壤养分资源的充分利用具有重要意义。本研究鉴定了一个受低磷胁迫上调表达的大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP15a。研究表明大豆根系外源植酸磷的高效利用依赖于该基因的表达。而且，GmPAP15a在Asn144和Asn502位点存在N-糖基化修饰。进一步研究表明这两个糖基化位点的修饰对于维持GmPAP15a酶活性起着重要作用。此
2023-09-18

海洋学院王俊教授团队在环境微/纳米塑料污染研究领域取得新进展

10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@海洋学院王俊教授团队在环境新型污染物微/纳米塑料（MNPs）的生态毒性效应评估、复合污染物相互作用、污染修复与降解技术开发等方面取得了系列新的研究进展，从2023年1月至今，研究团队正式发表高水平SCI论文28篇，包括9篇Journal of Hazardous Materials（中科院一区，影响因子13.9）、1篇Chemical Engineering Journal （中科院一区，影响因子15.1）、5篇TrAC Trends in Analytical Chemistry（中科院一区，影响因子 13.1）、1篇Water Research（中科院一区，影响因子 12.8）、12篇Science of the Total Environment（中科院一区，影响因子 9.8）等国际著名期刊上，同时出版英文专著1部，参编英文专著1部。团队在环境科学与生态学领域国际著名杂志Journal of Hazardous Materials上发表了题为“Trophic transfer of nanoplastics and di(2-ethylhexyl) phthalate in
2023-09-15

王海洋教授团队联合中国农科院作科所发现广谱抗黑条矮缩病毒新基因

2023年9月14日，10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@生命科学学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室和岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋教授团队联合中国农科院作科所在Nature Plants（影响因子17.352）在线发表了题目为“A transcription factor ZmGLK36 confers broad resistance to maize rough dwarf disease in cereal crops”的研究论文(论文链接:https://www.nature.com/articles/s41477-023-01514-w)，文章揭示了ZmDBF2-ZmGLK36- ZmJMT/ZmLOX8分子模块调控玉米抗粗缩病的遗传基础，为作物抗病改良提供了基因资源。玉米粗缩病是一种世界性的病毒病，由斐济病毒属（Fijivirus）病毒通过灰飞虱介导传播。在我国，玉米粗缩病主要由水稻黑条矮缩病毒（Rice black-streaked dwarf virus, RBSDV）引起，发病严重时造成绝收。除玉米外，RBSDV还会引起水稻和小麦等多种禾本科作物病害。迄今为止，能够同时提
2023-09-14

林学与风景园林学院树木学研究组报道山刺番荔枝的高质量基因组

植物基因组数据快速积累为植物分类和系统演化提供了越来越多的生物信息性状。近日，林风学院唐光大副教授与福建农林大学刘仲健教授团队合作在Ornamental Plant Research 杂志发表了题为“The Annona montana genome reveals the development and flavor formation in mountain soursop fruit 的研究论文”（链接：https://doi.org/10.48130/OPR-2023-0014），完成了山刺番荔枝的全基因组测序。通过比较基因组学分析表明木兰科植物是真双子叶植物的姐妹，而基于串联法（ASTRAL）的系统发育树与并联法的系统发育树木兰科系统发育位置不一致，这可能是由不完全谱系分类（Incomplete Lineage Sorting, ILS）引起。全基因组复制（Whole genome Duplication, WGD）分析表明，山刺番荔枝和鹅掌楸的共同祖先经历了一次WGD事件，而这次WGD事件发生在木兰目和樟目分化之后。图1 山刺番荔枝花和果实图图2 番荔枝基因组系统发育进化林
2023-09-11

园艺学院朱世江团队揭示ABA控制菠萝黑心病的分子机制

近日，10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@园艺学院朱世江教授团队在Horticulture Research （农林科学一区Top期刊，IF5y = 9.0，IF2022 = 8.7）在线发表题为“AcbHLH144 transcription factor negatively regulates phenolic biosynthesis to modulate pineapple internal browning”的研究论文（论文链接：https://doi.org/10.1093/hr/uhad185）。该研究首次揭示了外源ABA控制菠萝黑心病的分子机制。菠萝黑心病，又称内生褐变（internal browning），是目前我国菠萝产业中最大的卡脖子问题之一，严重制约菠萝品质和产业发展。多年来，朱世江团队一直致力于攻克这一难题，于2015年在国际著名期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表了首次用外源ABA有效控制菠萝黑心病的研究成果（Zhang et al., 2015，Postharvest exogenous application of absci
2023-09-08

食品安全与营养团队在Analytical Chemistry发表封面文章

近日，分析化学领域国际权威期刊Analytical Chemistry以Supplementary Cover形式在线发表了题为“Structural Insights into the Stability and Recognition Mechanism of the Antiquinalphos Nanobody for the Detection of Quinalphos in Foods”的文章。文章通讯作者为徐振林教授，第一作者为博士生李家冬。纳米抗体通常来自骆驼、美洲驼、羊驼等驼科动物和鲨鱼中重链抗体的可变结构域，由于其出色的溶解性、高稳定性以及易进行基因工程改造等特性，一直是小分子污染物免疫分析中的研究热点。尽管目前已经有许多基于纳米抗体的小分子污染物免疫检测分析方法的报道，但是10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@纳米抗体的结构以及纳米抗体与小分子半抗原识别机制的研究较少，了解纳米抗体驱动其稳定性、亲和力和选择性的结构特征变得越来越有价值。该研究首次以喹硫磷为研究模型制备了抗喹硫磷的纳米抗体Nb-11A，并使用X射线晶体学解析了Nb-11A和喹硫磷以及三种交叉类似物（对硫磷，三唑磷和蝇毒磷）的复合物
2023-09-05

林学与风景园林学院联合农学院合作发表高水平研究论文

近日，10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@林学与风景园林学院葛良法教授和农学院年海教授合作在国际著名杂志JIPB （Journal of Integrative Plant Biology）发表题为“Natural variation of GmFATA1B regulates seed oil content and composition in soybean”的高水平研究论文（DOI: 10.1111/jipb.13561）。大豆是起源于我国的重要粮食和油料作物。油分含量和脂肪酸组成是大豆重要的品质性状，在不同的大豆资源间展现很大的变异。虽然大豆油分含量和脂肪酸组成方面的研究取得了一些重要进展，但仍有很多数量性状位点（QTL）及主效基因需要被进一步揭示，其在大豆分子设计育种上的应用也需要进一步研究。该研究成功克隆了课题组前期在大豆第8号染色体定位的油分QTL（qOil-8-1）主效基因GmFATA1B。GmFATA1B编码酰基-ACP硫酯酶（Acyl-ACP thioesterase）蛋白，参与大豆油分合成和脂肪酸代谢。低油单倍型GmFATA1BWY在第6个外显子上产生9个氨基酸的插入，导致编码蛋白产生结构变异
2023-09-05

园艺学院朱世江/王光团队在菠萝黑心病无损检测方面的研究取得进展

10bet官网中文_bet十博体育app-【中国科学院】@园艺学院朱世江教授团队在菠萝黑心病的防控及其机理解析方面开展了多年的研究工作，近日在菠萝黑心病的无损检测方面取得了新的研究进展，9月1日在Food Chemistry （农林科学1区Top期刊，IF2022= 9.231, IF2023=8.8）在线发表了题为“Discrimination of internal browning in pineapple during storage based on changes in volatile compounds” 的研究论文（论文链接：https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2023.137358）。该论文介绍了黑心病对菠萝挥发性物质的调控作用，并以此为基础建立了一种以电子鼻为主的菠萝黑心病无损检测模型。菠萝（Ananas comosus [L.] Merrill）是凤梨科凤梨属多年生常绿草本果树，是我国南方最具特色和竞争优势的热带水果之一，其中‘巴厘’菠萝是我国菠萝的主要栽培品种。然而，‘巴厘’菠萝极易发生黑心病，目前未有有效的商业化防治方法。黑心病是采后菠萝的一种主要生理性病害，发病时菠萝外部

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